Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDK5Q00535 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms