Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNB1P98172 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms