Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VLDLRP98155 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms