Protein–RNA interactions for Protein: P86480

PRR20D, Proline-rich protein 20D, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR20DP86480 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20DP86480 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms