Protein–RNA interactions for Protein: P86479

PRR20C, Proline-rich protein 20C, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR20CP86479 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PRR20CP86479 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms