Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPM4P67936 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TPM4P67936 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPM4P67936 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPM4P67936 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms