Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms