Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR2FP61218 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR2FP61218 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR2FP61218 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2FP61218 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2FP61218 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms