Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVFRD-1P60508 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms