Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHMP4BP1P59074 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHMP4BP1P59074 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms