Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ELLP55199 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ELLP55199 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ELLP55199 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms