Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB4P54760 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB4P54760 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms