Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAD23AP54725 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23AP54725 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms