Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOSBP53539 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSBP53539 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSBP53539 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSBP53539 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSBP53539 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms