Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CLCN3P51790 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLCN3P51790 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms