Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAMP50895 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BCAMP50895 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BCAMP50895 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BCAMP50895 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAMP50895 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAMP50895 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAMP50895 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAMP50895 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAMP50895 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAMP50895 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAMP50895 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAMP50895 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAMP50895 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAMP50895 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAMP50895 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAMP50895 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAMP50895 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAMP50895 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAMP50895 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAMP50895 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAMP50895 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAMP50895 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAMP50895 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAMP50895 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCAMP50895 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCAMP50895 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAMP50895 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAMP50895 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAMP50895 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAMP50895 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCAMP50895 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms