Protein–RNA interactions for Protein: P46777

RPL5, 60S ribosomal protein L5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL5P46777 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL5P46777 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL5P46777 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL5P46777 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL5P46777 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL5P46777 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL5P46777 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL5P46777 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL5P46777 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL5P46777 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL5P46777 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL5P46777 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms