Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF9P41273 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms