Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCAP37840 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCAP37840 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms