Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXD13P35453 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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HOXD13P35453 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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HOXD13P35453 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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HOXD13P35453 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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HOXD13P35453 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HOXD13P35453 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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