Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCGF2P35227 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms