Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RYKP34925 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RYKP34925 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RYKP34925 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RYKP34925 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms