Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCND3P30281 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCND3P30281 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCND3P30281 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCND3P30281 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCND3P30281 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms