Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5DP30049 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5DP30049 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms