Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTGFP29279 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTGFP29279 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTGFP29279 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTGFP29279 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTGFP29279 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms