Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR2AP24928 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR2AP24928 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms