Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5F1P24539 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATP5F1P24539 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms