Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA6P23229 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA6P23229 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms