Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPD1P21695 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPD1P21695 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GPD1P21695 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPD1P21695 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPD1P21695 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPD1P21695 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPD1P21695 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPD1P21695 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms