Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT1P21579 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT1P21579 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT1P21579 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT1P21579 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT1P21579 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT1P21579 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT1P21579 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT1P21579 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT1P21579 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT1P21579 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT1P21579 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms