Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXA5P20719 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXA5P20719 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms