Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms