Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms