Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACADSP16219 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACADSP16219 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACADSP16219 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACADSP16219 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSP16219 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSP16219 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSP16219 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSP16219 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSP16219 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSP16219 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSP16219 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACADSP16219 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms