Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKAR2AP13861 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKAR2AP13861 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms