Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms