Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARBP10826 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARBP10826 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RARBP10826 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RARBP10826 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RARBP10826 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RARBP10826 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms