Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NR2F1P10589 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms