Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL3P10147 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL3P10147 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCL3P10147 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms