Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM10L2AP0DMW4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2AP0DMW4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM10L2AP0DMW4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms