Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRGC1P0CF51 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms