Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYCNP04198 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MYCNP04198 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MYCNP04198 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYCNP04198 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYCNP04198 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms