Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGAP02671 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGAP02671 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGAP02671 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGAP02671 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGAP02671 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGAP02671 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FGAP02671 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms