Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IGKV1-5P01602 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IGKV1-5P01602 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms