Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SERPINA1P01009 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SERPINA1P01009 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms