Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC2O95347 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC2O95347 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC2O95347 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC2O95347 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC2O95347 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC2O95347 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC2O95347 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC2O95347 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC2O95347 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC2O95347 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC2O95347 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC2O95347 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC2O95347 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC2O95347 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC2O95347 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC2O95347 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC2O95347 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms