Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP19O94966 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP19O94966 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP19O94966 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP19O94966 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP19O94966 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP19O94966 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
USP19O94966 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP19O94966 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP19O94966 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP19O94966 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP19O94966 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP19O94966 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP19O94966 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP19O94966 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP19O94966 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP19O94966 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP19O94966 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP19O94966 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP19O94966 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP19O94966 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP19O94966 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP19O94966 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP19O94966 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP19O94966 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP19O94966 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP19O94966 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms