Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F6O75461 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F6O75461 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
E2F6O75461 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms