Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTNSO60931 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTNSO60931 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTNSO60931 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTNSO60931 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms