Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SUSD5O60279 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SUSD5O60279 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms